Aparici en Órbita s05e10: Inteligencias artificiales para desvelar el secreto de las proteínas, con Gonzalo Jiménez Osés

El funcionamiento de la materia viva es uno de los grandes temas de la ciencia moderna. Ahora sabemos que nuestra biología es el resultado de millones de procesos químicos y físicos que tienen lugar continuamente dentro de nuestros cuerpos y, a menudo, dentro de nuestras células. Las proteínas juegan un papel muy importante dentro de esos procesos: ellas son los "obreros", la fuerza de trabajo fundamental de los organismos vivos. Las proteínas encuentran patógenos y los neutralizan, realizan labores de limpieza dentro de las células, transportan el oxígeno y el CO2 dentro de nuestros cuerpos... la lista de sus funciones es prácticamente infinita. Sabemos desde hace más de 50 años que las "instrucciones" para fabricar estas proteínas están escritas en el ADN, y que por eso es tan importante este ADN y está presente en casi todas las células de nuestro cuerpo. Pero el proceso de construcción de una proteína es tan complejo que sólo conocer el ADN no basta: después de eso la proteína va a tener que "madurar", como los vinos. La proteína se va a retorcer, a enrollar y a ensamblar hasta convertirse en las máquinas moleculares que vemos en acción en los seres vivos. Y esta segunda parte del proceso es muy complicada y, en muchos aspectos, muy desconocida. Hoy os hablamos en la sección sobre todo este proceso, y cómo dos inteligencias artificiales nos están enseñando cómo se produce este proceso de ensamblado. Han sido dos inteligencias "no humanas" las que primero han logrado desentrañar cómo se construyen las proteínas: se llaman AlphaFold2 y RoseTTAFold, y sus creadores acaban de recibir el Premio Fronteras del Conocimiento en Biomedicina de la Fundación BBVA. Se trata de Demis Hassabis y John Jumper por AlphaFold2 y David Baker por RoseTTAFold. Hoy os contamos cómo estos dos programas han cambiado nuestra forma de abordar la biología molecular con la ayuda de Gonzalo Jiménez Osés, químico computacional y experto en diseño de proteínas en el instituto CIC bioGUNE de Bilbao. Si os interesa este tema podéis repasar otros programas de nuestro pódcast hermano, La Brújula de la Ciencia, en los que hemos hablado de él desde varios puntos de vista. En los episodios s10e19 y s01e17 os hablamos de ese proceso de construcción de una proteína, y en los episodios s08e16 y s10e17 os contamos en directo el terremoto que supuso la irrupción de AlphaFold en el panorama científico. Este programa se emitió originalmente el 2 de febrero de 2023. Podéis escuchar el resto de audios de Más de Uno en la app de Onda Cero y en su web, ondacero.es